Мало настроить контроллер CAPsMAN, нужно еще на каждой точке включить управление контроллером:
/interface wireless cap
set bridge=bridge caps-man-addresses=192.168.88.1 enabled=yes interfaces=\
wlan1,wlan2
где 192.168.88.1 - IP адрес вашего CCR2004-1G-12S-2XS
Предварительно рекомендую сбросить каждую точку
/system reset-configuration no-defaults=yes keep-users=no skip-backup=no