К коментариям в соседнем ответе :)
Eruol, да это не шутки,
tukreb просто неправильно понял, с какой стороны 2 пина, а с какой 4.
Теоретически то, что он написал в ответе могло бы иметь место, если бы наоборот на карте было 4 пина, а на вентиляторе 2. Хотя я не слышал о подобных проблемах в реальной жизни. Но мало ли.
В любом случае, сказанное не относится к вашему случаю. Когда на карте 2 пина, то карта и не пытается определять скорость вращения - измерительного пина нет на самой карте. Насчёт шума на максимальных оборотах тоже неверно. При двух пинах, если карта в принципе захочет регулировать скорость вращения вентилятора, она будет регулировать тупо напряжением питания.