Пользуюсь VmBox с установленной Ubuntu 20, выделил под все это дело 20гб. После первого входа в систему установил все пакеты и инструменты с которыми буду работать, установил так же докер. В итоге осталось около 7-8 гб свободного места.
За все время работы ничего не скачивал, однако место постепенно исчезало, в итоге сейчас осталось всего 48мб. Сделал sudo apt-get clean, очистил около 600мб и они вскоре так же быстро испарились.
Не совсем разбираюсь в Ubuntu, может кэш где лежит тяжелый или еще что
Начните с исследования занимаемого места, по файлам, утилит тьма - консольный ncdu (ищите в пакадж менеджере Ncurses Disk Usage) например, графический тот же baobab (disk usage analyser) или QDirStat
Если у вас много примонтированных разделов (например с циклами с помощью bind или сетевые) можно в настройках ограничить анализ одним диском (ncdu -x / например)