Если нужен просто разный js-код для разных языков, то создайте в менеджере модулей модуль типа HTML-код, вставьте туда нужный код и назначьте язык. Для каждого языка свой модуль со своим кодом. Позицию можно указать любую для всех страниц, лучше ближе к концу страницы (зависит от Вашего шаблона). Не надо мудрить и лезть в код шаблона. DirectPHP тоже для других целей создан.