Есть разные алгоритмы шифрования. И есть разные модели Mikrotik'ов,
некоторые модели поддерживают аппаратное ускорение для
некоторых алгоритмов шифрования. Информация в таблице:
https://wiki.mikrotik.com/wiki/Manual:IP/IPsec#Har...
Например, по таблице видно, что модель 4011 поддерживает все перечисленные алгоритмы (DES and 3DES, AES-CBC, AES-CTR, AES-GCM) в сочетании со всеми перечисленными алгоритмами хеширования (MD5, SHA1, SHA256, SHA512). Модели подешевле умеют меньше, конечно.