Куда вы устанавливаете софт, который получен не через менеджер пакетов?
Допустим, вам нужна программа, для которой нет deb/rpm/etc пакета, а есть только .tar.gz-архивчик. Куда в файловой системе вы складываете такие программы? В домашнюю директорию? В /opt? Ещё варианты?
Если собирал сам (а также для собственных программ) - /usr/local
Если пакет готовый, но ему все равно куда встать - обычно в /opt, хотя раньше такие тоже пихал в /usr/local (это например rar, mibbrowser, xnview)