в почтовых шаблонах есть шаблон: Тип почтового события: Разрешение оплаты заказа [SALE_ORDER_ALLOW_PAY]
с примерно таким содержимым:
Информационное сообщение сайта #SITE_NAME#
------------------------------------------
Разрешена оплата заказа N#ORDER_ID#.
Вы можете оплатить перейдя по ссылке #SERVER_NAME#/personal/order/#ORDER_ID#
Эту ссылку отредактируйте как вам надо.
#SERVER_NAME#/personal/order/ORDER_ID=#ORDER_ID#&PAYMENT_ID=#ORDER_ID#/
Чтобы сразу перекидывало на страницу банка, то надо еще HASH передавать.
В этом случае можно в init.php получать HASH, формировать переменные и их отправлять в конкретный почтовый шаблон.