Пробовали несколько раз переустанавливать (на разные окружения).
На какие окружения пробовали ставить? Родное Bitrix Env пробовали?
Может в какую хоть сторону глянуть подскажите?
1) Bitrix Server Test - сначала прогоните скрипт
2) Проверка системы - затем исправить ошибки тут
3) Проактивную защиту на время теста лучше отключить (можно попасть на самоблокировку)
p/s влияет ли на эти тесты init.php? (его нету)
Если его нет - влиять не может, а вот если он есть то в зависимости от того что в нем написано