Никуда :)
C чего Вы вообще взяли, что это все заработает в линухе? Коммерческие программы типа фотожопа - сразу мимо (wine не поможет). Игры - 90% мимо, что бы там про steam и playonlinux не говорили - ну не выходит каменный цветок :) Старые игры - нулевых, середины десятых - может быть заработают.
Адаптированные пакеты обычно ставятся в /usr. Неадаптированные типа "все-свое-ношу-с-собой" (virtualbox, rar, thunderbird) - в /opt