Как уже писали выше в про версии есть Options, он позволяет делать сквозные настройки.
С обычной версией мы поступали так:
Создаешь страницу, называешь ее Настройки или как угодно. Делаешь ее приватной, чтобы она нигде не светилась
И к ней уже привязываешь все поля которые хочешь выводить в хедере, футере или еще где.
А выводишь точно так же, только указываешь ID страницы, например ID у нее 7.
тогда <?php the_field('some_option', 7); ?>