Если я правильно понял, то истекла не лицензия, а срок технической поддержки?
Если так, то да, ничего вам не мешает сделать бэкап и развернуть его в другом месте. Но это нарушение лицензии битрикс) Возможно они вам напишут, "попросят" удалить.
Из негативных последствий - точно знаю, что не сможете обновлять оба сайта, только один. Если попытаться обновить второй сайт, то на каком-то из них(или обоих) будет заблокирована возможность обновления.