Да собственно в любой, хоть на бумаге начертить. В чём можешь создать полноценную 3Д модель в том и делай.
Проблема в том чтобы точно замерить все размеры и габариты платы и остальных устройств с учётом размещения посадочных отверстий.
Проще всего взять имеющийся корпус и отдать его на сканирование 3Д сканером в спец фирму. Полученную модель потом доработать под свои требования.
Рисуешь модель, печатаешь на 3Д принтере, пытаешься собрать бук, дорабатываешь модель с учётом выявленных косяков, печатаешь заново и так до идеала.
Посмотри тут на хабре есть статьи например про самодельные клавиатуры произвольной формы, близкая тематика.
Можно и алюминиевый сделать, но фрезеровка корпуса из куска алюминия выйдет беспощадно дорого.
Плюс будет геморрой с всякими там шлейфами и проводами, надо чтобы в новом корпусе они по длине подошли либо как-то их удлинять.