№1. Договор подряда, или договор возмездного оказания услуг, (когда аванс, когда расчет, очередность выставления счетов), договариваетесь с исполнителем, заказчиком, и вносите в договор, то же касается и акта приемки, исполнитель должен продемонстрировать функционал, и объяснить все интересующие заказчика моменты. (в договоре это прописывается как техподдержка).
№2. Договор подряда, или договор возмездного оказания услуг, соответственно прописываете уже не создание сайта, а администрирование.
№3. Та же последовательность действий, все зависит, с кем вы заключаете договор (аудит)
Все шаблоны договоров есть в сети, Google вам в помощь.
№4. С учетом вашего вопроса я не вижу какого либо участия ген дира в производственном процессе, поэтому - перебьется : )
