Не пробовал, но весьма вероятно, что
QuickSilver можно настроить на такие действия.
Для описанного кейса в Mavericks есть нативный
Notification Center, два пальца скользнуть из-за границы тачпада справа, на тачпад - откроется справа панель с последними "новостями" от приложений. Чтобы "прочитать и закрыть" — идеальнее не придумать. Остаётся настроить приложения, чтобы туда отправляли свои уведомления.