Хз, как там работает в ангуляре, но в Yii все просто: компилируете scss своим редактором/js сборщиком, полученный css (итоговый) ставите в файл ассетов. Всё.
При необходимости можете сделать несколько базовых scss-файлов, и каждый из них подключать как ассет на тех или иных страницах.
BEM-методология не подразумевает никакого include-подключения, это просто соглашение по именованию блоков. Если я ошибаюсь, поправьте.