При загрузке система инициализирует оборудование и обычно сбрасывает контроллер, чтобы определить устройства на шине. Какие-то материнки просто переинициализуруют шину, какие-то ещё питание дёргают. Посмотри настройки USB в BIOS, там может быть что-то про питание. Ну и обнови BIOS, если на сайте производителя есть свежий образ.