Суть в чем, есть ли какой-то сервис для наладки этого процесса?
не очень
Или все придется вручную программистам прописывать?
А потом еще руками отправлять каждому контрагенту будете оплаты.
Поэтому прописывать программистам особо нечего т.к. это делается в плоскости бухгалтерии и в целом особо не автоматизируется на мелких объёмах(если вы не какой-нибудь алиэкспресс и т.п.).
Программисты в лучшем случае пишут некую статистическую систему чтобы понимать сколько кому надо отправлять. Остальное - руками.