print(user[5])
В пишарм откройте интерпретатор и там так же будут работать команды. Запуская скрипт вы запускаете скрипт, со всеми вытекающими, готовый код. Он у вас ничего выводить не должен, вот и не выводит.
А в интерактивной консоли - почитайте о ней, у того же лутца начинается все с её описания.