Что вы используете для передачи данных в гугл таблицу? Плагин или самописный код?
Вероятнее всего, что где-то на вашем сайте (например в бд) хранится номер последней заполненной строки. И в следующий раз, когда отправляется форма, данные прилететают в строку с номером +1. А раз вы удаляли строки из таблицы вручную, избегая сайт, то и получаются эти пропуски.
Можно перед отправкой данных в таблицу, получать с нее данные, находить последнюю заполненную строку (на актуальный момент времени) и засовывать данные в следующую строку.