1. положи в бин файл который собираешся запускать( расширение в линуксе не сущетсвует, это просто часть файла) так что можешь назвать его vasya
2. внутри положи свой пхп код
3. в первой строке поставь вот это
#!/usr/local/bin/php
Ну или где там у тебя лежит сам php
4. сделай файл запускаемым chmod 700 ( запускаемость в линуксе атрибут)
все , файл запустится а перая строчка скажет чем интерпретировать.
не забывай что для линукса нет разницы в интерпретаторах, просто по умолчанию стоит sh, но никто тебе не запрещает поставить по умолчанию C или php, так кто будет делать вывод линуксу вообще фиолетово, кого назовешь тот и тузик.