Без понимания как организовано сейчас в данный момент довольно трудно давать совет, т.к. это все может сломать существующий хост или виртуалки перестанут запускаться. Как уже писали, сделай копии существующих машин, скопируй на внешний носитель, запомни настройки сети, установи заново proxmox, учитывая сколько места для чего требуется(в инсталляторе есть такой функционал) и потом восстанови виртуальные машины из копии.
