Для начала, определиться с тем, какой у вас веб сервер:
ss -ntpl
покажет, что у вас какие порты слушает. Надо найти, что слушает 443 порт. Будет понятно, что надо будет перезапускать и какой инструкции следовать при необходимости.
Далее, надо посмотреть, есть-ли папка /etc/letsencrypt, и если есть, проверить, установлен-ли certbot, и в каком варианте:
which certbot
which certbot-auto
А если нет, установить по инструкции для своего веб сервера/дистрибутива:
https://certbot.eff.org/
Если один из них установлен, запустить:
certbot renew
И посмотреть, обновится-ли сертификат, или будет какая-то ошибка.
Если обновиться, проверить /etc/cron.d и crontab рута, на наличие задания по обновлению сертификатов, если нет добавить.
Если что-то пойдёт не так, соответственно, задавать дополнительные уже конкретные вопросы.