Если у вас php-fpm на tcp висит, то конечно - на каждый запрос обрабатываемый будет соединение с 127.0.0.1 на 127.0.0.1, т.е. от веб сервера к php-fpm. И если у вас затык какой, то запросы встают в очередь, и количество одновременных соединений конечно растёт. Т.е. это, скорее всего, просто побочный эффект проблемы, а не она сама.
У php-fpm есть статистика, её можно посмотреть когда есть проблема, и понять, что происходит, какие запросы обрабатываются в данный момент. Логи веб сервера стоит поглядеть, нет-ли там наплыва запросов. Также, возможно, у вас слишком велик лимит на количество процессов php для ваших ресурсов, или не правильно распределена память в целом.