Только мне кажется, что жидкий интерфейс — это хорошо, но в данном примере речь вовсе не об этом?..
$PHPExcel_file->getActiveSheet() возвращает объект Sheet, у которого дальше вызывается метод ->getCellByColumnAndRow('3', $i), возвращающий объект Cell, и уже у этого объекта вызывается ->getValue(), что и получает нужное значение.
А пример fluent interface для PHPExcel был бы, например, таким:
$objPHPExcel->getActiveSheet()->setCellValue('A1', "Here we go")
->setCellValue('A3', "Number:")
->setCellValue('B3', "10")
->setCellValue('A5', "List:")
->setCellValue('B5', "Item A");