Сначала вам необходимо выбрать второй диск загрузочным в настройках BIOS. И только потом ставить ОС на этот диск, желательно с полным форматированием. Иначе винда при установке может разместить загрузчик не там, где надо. Если выбора загрузочного диска в BIOS нет — а такое вполне может быть на ноутбуке, то возможно есть опция выбора CD/DVD загрузочным либо ставить какой-то загрузчик на USB флешку и поставить её первой в списке на загрузку и грузить сначала флешку, а с флешки грузить диск с ОС (колхоз, конечно, но работать будет).
