Если конфигурация типовая (отключена возможность редактирования), то для внесения изменений в макет необходимо создать ВПФ (внешнюю печатную форму), можно это сделать самостоятельно. Информации о создании ВПФ на просторах интернета масса. Либо скачать готовую ВПФ, например с инфостарта, для вашей конфигурации и внести изменения в макет. Этот механизм позволит безболезненно обновлять конфигурацию БД типовыми средствами, без сравнения и объединения. Но Вас наверняка интересуют технические подробности. В общем конкретизируйте вопрос (какая конфа, что и куда нужно добавить), с удовольствием отвечу