Нашел частичное решение проблемы, если посмотреть сюда, а именно перейти к file и к 'checkExtensionByMimeType', и изменить значение по умолчанию на false, то получается решение проблемы, а именно теперь можно загружать файлы, формата rar. Почему именно этот формат не удается загружать без проверки соответствия майм тайпа непонятно.
В результате получено:
public function rules(){
return [
['file', 'file', 'extensions' => 'tar,png, jpg, jpeg, gif, docx, xlsx, pdf, rar, djvu, zip, 7z, txt,', 'maxSize' => Yii::$app->params['fileMaxSize'], 'maxFiles' => 5, 'checkExtensionByMimeType' => false],
[ ['file'], 'required' ],
];
}
А частичное потому, что приведение checkExtensionByMimeType в false не всегда может быть хорошо.