Перед двоеточием импортируемый модуль app.py, а после двоеточия переменная app, содержащая wsgi application, которому сервер uWSGI будет передавать запросы.
Почему не просто `module = app` ?
По той же причине, по которой не просто `uwsgi --http :9000 --wsgi-file app.py`