Не думаю, что приходится под сотню раз вводить рутовые пароли на разных серверах по тем или иным причинам. В крайнем случае, когда это осточертело, есть менеджер паролей KeePass, с помощью которого можно быстро вставлять пароли и не бояться, что они куда-то не туда попадут из буфера обмена.
Считайте, что это ваша двуфакторная авторизация.