А где пример когда который это делает? PhantomJS можно запусить в дебаг режиме, тогда в консоле будут видны все проблемы которые у него возникли при работе.
я использую вот ету библиотеку https://github.com/prerender/prerender
иногда некоторые страницы возвращают пустой документ, хотя на самом деле контент там есть
Vanya Huk, Не важно, какую библиотеку. Важен самостоятельно написанный код и описание, каким образом запущен PhantomJS. Без этого смысла гадать "почему" нет.