Интересует файловй менеджер, программа или иной совет как рабоать с архивами?
Я параноик! Все данные в том числе и фото храню в архивах. Хотел посмотреть фото, а архив не извлекает всё, где то половину из того, что есть на нём. Просматривать по одному файлу можно, правда иногда долго думает. У меня три пути...оставить как есть, реанимировать архив (zip исправить) или же искать альтернативу для работы с тем, что имею. (zip архивы)
А если серьезно: реанимировать архив (если и пока еще возможно) и перестать страдать хренью.
Если у вас прям свербит - используйте шифрование (например бесплатный и входящий в состав Windows - BitLocker).
А какой вообще безопасности вы добиваетесь с помощью zip? Ладно бы rar или 7z они хотя бы архивировать с паролем умеют.