true\false - в зависимости от этого на фронте уже можно управлять выводом и даже наличием самого окна.<?php if( $globalVars['showPopup'] === true ): ?>
<div id="myModal">
. . . . .
</div>
<?php endif; ?> <button type="button" class="dva">Включить</button>
<button type="button" class="dva">Отключить</button><div style="text-align: center;">
<a href="#win1" class="button button-green" id="block" >Модальное окно</a>
</div><script>
setTimeout(function myFunction() { document.getElementById("block").click(); }, 5000);
</script>
if ($config->showModal) {
...
}