ID пользователя уже есть в Yii::$app->getUser()->getId();
Передаете id комментария и, получаете комментарий, указав в выборке id пользователя, либо, тащите этот комментарий из базы и сравниваете поле, отвечающее за id пользователя комментария с id текущего пользователя. Если разные - throw new ForbiddenHttpException();