Большая часть программ для инсталляции использует штатную подсистему Microsoft Windows - Windows Installer.
Пока одна программа использует эту подсистему - остальные нервно курят в ожидании пока она освободится.
Если не использовать стандартные механизмы можно устанавливать и удалять хоть сотню программ одновременно.