XMP/IPTC - довольно очевидный вариант хранения метаинформации фото. Относительно вариантов 2 и 3 преимущества очевидны: не требуется дополнительных инструментов и операций.
Так что остаётся подобрать подходящий софт, работающий с разметкой лиц и сохранением в метаданных внутри поддерживаемых форматов изображений.
Digikam, Windows Live Photo Gallery или другое ПО.