Подскажите, есть ли какие-нибудь логи загружаемых файлов на сервер? Т.е. когда юзеры на сайте загружают картинки и тд на сайт со своего ПК, чтобы это все писалось куда-то.
Смотря как они это делают.
Если по ftp, то можно посмотреть умеет ли ваш ftp сервер детализировать логи до файлов.
Если по ssh - нет.
Если по CMS, то причем тут Linux - смотрите что умеет логировать ваш CMS