Если интересует просто выполнение скриптов в защищённом паролем / пин-кодом режиме, то совсем необязательно что-то настраивать.
Единственное - в Windows должны быть выставлены довольно долгие (если не бесконечные) настройки по времени до отключения / перевода в ждущий или спящий режим.
Если это сделано, то жмите Win + L и идите по своим делам со спокойной душой (проверено в Win10).
P. S. Хотя, возможно, некоторые операции блокируются в Windows при блокировке, но это уже что-то специфичное, я думаю.