Делите координаты пикселя в текстуре с инфракрасной камеры на разрешение этой текстуры, получите нормализованные координаты. Нормализованные координаты совмещаете с перспективной матрицей инфракрасной камеры, получаете мировые координаты пикселя. Мировые координаты пикселя совмещаете с перспективной матрицей камеры глубины, получаете нормализованные координаты. Далее просто достаёте нужный пиксель из текстуры глубины либо из байтового массива, который предоставляет кинект. Скорее всего для всех этих операций в SDK кинекта есть нужные функции.