Воткните флешку с лампочкой сигнальной, такие есть у многих флешек, если она не загориться значит нет контакта. Нет контакта, значит вы его сломали. Если сломали то чините.
У меня был похожий случай. При подключении флэшки, между ней и разъемом проскочила искра (статика прошла). Так все стало как у вас. Т.е. все хабы видны, а при подключении usb-устройства тишина, пришлось ставить контроллер usb. Возможно при чистке у вас произошло что-то подобное.
Если после разборки такое стало, то надо проверить подключение проводов к USB. Точнее, переподключить провод. Возможно, он просто недостаточно глубоко был вставлен при сборке.
Провода надо проверять с двух сторон, конечно.
Вполне реально случайно задеть разъемы или провода.
Достаточно простой способ проверить порт без Windows — попробовать загрузить что-то с USB — Linux, XBMC, Windows и т.п.
Windows показывает не порты, а контроллер. Windows, к сожалению, не может знать подключен ли разъем к этому контроллеру или нет.
Если на USB загрузке, например, Linux'a порты не будут работать (можно туда воткнуть, например, мышку), то это железная проблема. Если порты заработают, то проблема в софте.
Предварительно можно на всякий случай сбросить настройки BIOS'а на установки по-умолчанию.
Средний