Для начала дайте ответы на вопросы:
1. Вам надо облачный сервис или его необходимо развернуть on premises?
2. Вам нужен бесплатный сервис?
3. Вам нужно документировать _только_ API или еще надо делать разные диаграммы, писать связный текст т.п.
4. Вам надо генерить документацию из кода автоматом?
По вашему тексту вопроса я вижу, что вы пока не можете сформулировать требования к системе. А это один из явных признаков очень сильно ошибиться при выборе системы. И, кстати, обратите внимание, что все участники треда выше предложили варианты, даже не спросив что конкретно вам нужно!