Потому что, когда винда уходит в гибернацию, она создаёт на NTFS-разделе страницу, которую помечает как start speedup cache. В этой странице находится кеш метаданных для быстрого старта, чтобы потом не читать их заново на старте и не тупить.
Вот этот кеш для линуксов не имеет никакого смысла. Мало того, раздел при монтировании видится как битый, потому что он помечается кучей своих флагов. Современные версии NTFS-3g предупреждают об этом и просят загрузиться снова в винду, чтобы она восстановила этот кеш. Ядерный же драйвер ntfs вообще пока не знает об этом, и может молча что-то записать поверх, и тогда ваша винда уже не загрузится.
Это что касается NTFS.
Ещё есть вероятность поломать EFI-раздел. Тут уж я не знаю, что делает с ним винда, но в момент гибернации, она тоже что-то оставляет не нём в неконсистентном состоянии, и при дальнейшем монтировании в линуксе, этот раздел видится битым. Если в этот момент на него что-то записать или попытаться "исправить", то уже все ваши операционные системы не смогут загрузиться.
На самом деле, можно и не отключать этот фастбут. Просто нужно постоянно помнить: не выключился ли у вас случайно комп, когда был в виндовой гибернации. Типа там, свет моргнул, или уборщица сетевой фильтр шваброй обработала, либо вы сами накосячили.
Средний
