Как обычно решаются ситуации, когда на работу приходит разработчик и ему предлагается компьютер, где установлен sublime text, а он говорит, что он привык работать на komodo ide. В итоге менеджер уверен, что никому кроме этого разработчика komodo не нужен, и если разработчик уйдет, то придется списывать в утиль эти расходы.
В итоге, как правильно поступать в этой ситуации: как с позиции менеджера, так и разработчика?
Для работодателя решаются в зависимости от того, нужен ли ему такой разработчик, и насколько. (Можно оплатить лицензию без возражений, можно потребовать обоснования и тогда оплатить, можно решительно не платить а заставить пользоваться пиратской на личном ПК или пусть сам платит, можно заявить "или пользуйтесь чем скажу или до свидания", можно еще какой-то компромисс придумать по ситуации.)
Для разработчика решаются в зависимости от того, нужен ли ему такой работодатель.