Железобетонно выгружаются только строки и числа.
Из своего опыта (я обслуживаю обмен со стороны сайта), если речь про список и его значения, ID значений должны быть прописаны в 1С для корректной выгрузки (по аналогии со связкой товаров и разделов по XML_ID).
Если есть возможность, подготовьте всё на стороне сайта, поднимите резервную 1С и сделайте выгрузку из сайта туда. И посмотрите, как они выгрузились.
Для связки каких-то хитрых свойств, храните в 1С строки и числа, выгружайте а на сайт в техническое (промежуточное) свойство, а по событию связывайте его и «чистовое».