Woo после установки создаст необходимые страницы: Магазин (страница с выводом всех товаров, по умолчанию слаг - shop), Корзина, Оформление заказа, Личный кабинет. Все шаблоны для вывода товаров естественно в плагине есть. Но вас никто не избавляет от необходимости написать тему. В теме woo использует шаблон woocommerce.php для своих страниц, в котором одна функция
woocommerce_content()
, которая определяет тип страницы и подтягивает нужный шаблон из шаблонов в самом плагине. Все шаблоны вы можете переопределять и кастомизировать. Оставляете главную на сайте как есть. index.php, например, или как у вас сейчас, я не знаю. Там вероятно есть header.php и footer.php. Создайте header-shop.php и footer-shop.php для использования на страницах магазина. Подключайте так
get_header('shop');
Еще почитайте здесь
virtum.com.ua/sozdanie-temy-dlya-woocommerce-kratk...