"Скопирован" понятие растяжимое. Если вы просто физически скопировали директорию файла, то создайте в нем новый бранч "oldsite" и подключите в виде ориджина к єтому бранчу папку старого сайта. После єтго вы можете сравнить два бранча.
Если вы склонировали старый сайт командой git clone то просто сравните два бранча ну или банч и его ориджин если вы по глупости не додумались сделать новый бранч