Опять же, скорее всего дело в ttl (возможно, еще и window size учитывается) и/или отличающихся настройках для вайфай-клиентов. Может у вас гостевая сеть включена какая-нибудь.
Connectify, видимо, более тщательно обрабатывает проходящий трафик, чем дефолтная прошивка роутера.
Я бы советовал смотреть анализатором на исходящие пакеты по проводу и по вайфай, искать, чем отличаются. Смотреть настройки файфая на роутере. Возможно, ставить какую-нибудь openwrt и ручками (iptables) рисовать nat с корректировкой всех значимых полей вроде ttl или window size