после обновления/установки чего-либо через composer, в конце операции выполняется команда assetic install, которая устанавливает все ассеты в папку web/bundles. Поэтому, если используете ассетик бандл, то храните все ассеты в src/AppBundle/Resources/public/*. Если не используете его, то например в web/css, web/js