насколько я понимаю, для начала придется доказать, что это GPL приложение. Насколько я вижу, вся схожесть пока сводится к интерфейсу. Доказать что програма в Appstore построена c GPL кодом, будет очень сложно и apple скорей всего даже не будет заморачиваться — предложит автору прийти к ним с судебным решением.
GPL? Тогда в общем случае никак. GPL никак не запрещает коммерческое использование кода, если предоставляются исходники. Можно разве что надавить на тему «открыть исходный код»