dd if=/dev/sdb1 of=/tmp/sdb1.dump
таким образом побайтово снимается информация о разделе.
Результат будет весить столько же, сколько и сам раздел. Т.е. если раздел 1G, а занято 1M, то файл все равно будет весить 1G.
А в целом по размеру бекапа лучше делать бекап данных и кофигов приложений.
Если хочется поэкспериментировать, а затем вернуть систему в исходное состояние можно воспользоваться снапшотами LVM (при условии, что у Вас разделы под LVM).