Перетащить всё на виртуалки, и бэкапить с помощью Veeam :-)
Насчёт "чем" бэкапить -- тут каждый выбирает то, что ему больше нравится. Кобиан, Бареос, встроенные виндовые бэкаперы. Когда у нас превалировали физические сервера, мы юзали Акронис для винды и dump/restore для FreeBSD. Но на тот момент акронис создавал больше проблем -- не было недели, чтобы я в саппорт не обращался, настолько оно глючило (это дела 2011-2013 годов). Может, с тех пор что-нибудь поменялось, не знаю.
Что касается "как" бэкапить -- то стратегия простая. По выходным обычно делаются полные бэкапы, а в будние дни по ночам -- дифференциальные или инкрементные архивы, в зависимости от объёма изменяющихся файлов в течение рабочего дня. И нужно регулярно делать проверку бэкапов -- пробовать разворачивать бэкапы куда-нибудь на тестовый стенд, чтобы убедиться, что у вас бэкапы не битые. В идеале также резервные копии должны храниться в двух географически удалённых местах. Т. е. даже не в одном здании. Так называемая тактика "3-2-1": у вас должно быть три резервные копии, две из них -- на разных физических носителях, причём одна из них должна храниться в другом здании.
Простой
. Например бухгалтерия имеет полные права в свою папку (чтение-запись-создание), в остальные только чтение и в АД, в профиль указывал, что домашняя папка у пользователя будет такая-то. Но,к сожаению я ненашел как сделать так, чтобы прописывать не каждому пользователю путь к корню DFS, а, например к группе. Т.к. 30пользователей еще руками это можно сделать, а вот когда больше 100 неприятно.
. Русскими буквами - корни. 
